Oberstes Organ des Vereins WPO ist die Mitgliederversammlung. Diese wählt die Delegierten und übergibt diesen mit der Wahl die strategische Vereinsführung. Die Delegiertenversammlung setzt sich aus sechs Vertretungen der Mitgliedsgemeinden Regio Wil und sechs Wirtschaftsvertreter/innen zusammen.
Der Vorstand setzt sich zusammen aus sechs Mitgliedern. Der Vorstand:
Wirtschaftsvertreter:
- Hansjörg Brunner, Fairdruck AG (Präsident)
- Marcel Mosimann, Mosimann Immobilien Treuhand AG
- Christof Oswald, Bühler AG
Vertreter Politik:
- Roman Habrik, Gemeindepräsident Kirchberg (Vizepräsident)
- Thomas Goldinger, Gemeindepräsident Wängi
- Hans Mäder, Gemeindepräsident Eschlikon
Ebenfalls Teil des Vorstands, jedoch ohne Stimmrecht, ist Robert Stadler, Standortförderer und Leiter der Geschäftsstelle WPO.